АҚ «Инфекцияға қарсы препараттар ғылыми орталығы»:
- Жаңа заттар мен материалдар зертханасы;
- Радиохимия және радиобиология зертханасы;
- Иммунология зертханасы;
- Микробиология зертханасы;
- Вирусология зертханасы;
- Бақылау – талдау зертханасы;
- Фармакология және токсикология зертханасы;
- Фармацевтикалық химия және технология зертханасы
- Жетілдірілген зерттеулер және АТ құралдары зертханасы.
ЖШС «Ұлттық биотехнология орталығы»:
- Иммунохимия және иммунобиотехнология зертханасы;
- Өсімдік биотехнологиясы және селекция зертханасы;
- Микроорганизмдердің генетикасы және биохимиясы зертханасы;
- Дің жасушаларының зертханасы;
- Токсикология және фармакология зертханасы;
- Ұжымдық пайдалануға арналған ұлттық биотехнология ғылыми зертханасы;
- Өсімдіктердің генетикалық инженерия зертханасы;
- Биоәртүрлілік және генетикалық ресурстар зертханасы;
- Өсімдіктер геномикасы және биоинформатика зертханасы;
- Протеомика және масс-спектрометрия зертханасы;
- Гендік инженерия зертханасы;
- Қолданбалы генетика зертханасы;
- Адам генетика зертханасы;
- Молекулалық биотехнология зертханасы.
Алматы қаласындағы филиалы (Биологиялық қауіпсіздік):
- Молекулалық биология зертханасы;
- Зерттеу және диагностика зертханасы;
- Иммунология және иммунобиотехнология зертханасы;
- Биологиялық қауіпсіздік және биоқорғау бөлімі;
- Инновациялар және әзірлемелер басқармасы;
- Қауіпті және аса қауіпті қоздырғыштарды секвенирлеу және геномдық талдау бойынша анықтамалық орталығы.
Степногорск қаласындағы филиалы (Өнеркәсіптік биотехнология):
- Қолданбалы биотехнология зертханасы;
- Биологиялық өнімдер зертханасы;
- Биогеотехнология зертханасы.
ЖШС «Қазақ ғылыми-зерттеу ветеринария институты»:
- Бактериология зертханасы;
- Вирусология зертханасы;
- Бруцеллез зертханасы;
- Паразитология және микология зертханасы;
- Молекулалық генетика және тамақ өнімдерінің қауіпсіздігі зертханасы;
- Микроорганизмдер коллекциясы зертханасы.
ЖШС «Республикалық микроорганизмдер коллекциясы»:
- Микробиология зертханасы;
- Микроорганизмдердің генетикасы және биохимиясы зертханасы;
- Биотехнология зертханасы;
- Өндірістік микроорганизмдердің биобанкі;
- Антибиотиктерге және екіншілік метаболиттерге арналған пәнаралық шешімдер орталығы.
ЖШС «Биомедпрепарат» ғылыми-талдау орталығы»:
- Бақылау зертханасы.
ШЖҚ РМК «Биологиялық қауіпсіздік мәселелері ғылыми-зерттеу институты»:
- Микробиология зертханасы;
- Жұқпалы ауруларды диагностикалау зертханасы;
- Биологиялық өнімдердің дайын формаларының технологиясы зертханасы;
- Молекулалық биология және гендік инженерия зертханасы;
- Жасушалық биотехнология зертханасы;
- Ұжымдық пайдалану зертханасы;
- Микроорганизмдер коллекциясы зертханасы;
- Микроорганизмдерді өсіру технологиясы зертханасы;
- Жұқпалы аурулардың алдын алу зертханасы;
- Жұқпалы ауруларды бақылау зертханасы;
- Ерекше қауіпті жұқпалы аурулар зертханасы;
- Технология және биологиялық өнімдерді бақылау зертханасы;
- Фитосанитарлық қауіпсіздік зертханасы.
Қазақстан Республикасы Денсаулық сақтау министрлігінің «Масғұт Айқымбаев атындағы аса қауіпті инфекциялар ұлттық ғылыми орталығы» ШЖҚ РМК:
- Оба зертханасы;
- Тырысқақ зертханасы;
- Зоонозды бактериялық инфекциялар зертханасы;
- Табиғи ошақты вирустық инфекциялар зертханасы;
- Виварий мен клиникаға дейінгі зерттеулерге арналған зертхана;
- Мұражай және инсектарийі бар ерекше қауіпті инфекциялардың эпизоотология зертханасы.
ЖШС «ОтарБиоФарм»:
«ОтарБиоФарм» ЖШС-да сапаны бақылау бөлімі бар, оның құрамына келесі зертханалар кіреді:
- Микробиология зертханасы;
- Химиялық бақылау зертханасы;
- Биологиялық бақылау зертханасы.